UPD: У меня не всегда хватает времени оформить новые солюшены. Поэтому можете заглядывать сразу в мой рабочий солюшен лист — ubuntu_bible. В нем всегда свежие решения с краткими комментами.

* Обязательные действия после установки Ubuntu
* Ubuntu выключить PC-Speaker
* Отключить CapsLock
* Настройки клавиатуры не сохраняются
* При проигрывании видео слишком яркие/неправильные цвета
* Слишком частая проверка дисков в Ubuntu
* Клавиатура от Apple
* Софт для Ubuntu
* Firefox прячет показывает меню при нажатии alt
* Firefox 3 Tab Mix Plus
* Не работает Java в Firefox 3
* Utorrent под Ubuntu сильно тормозит
* Ubuntu создать архив с паролем
* Ubuntu установить и настроить Photoshop CS2
* Проблемы с Virtual Box
* Установить свежую версию Wine
* Не открывается Rar/видео/музыка

Ubuntu Faq:

* Сразу после установки Ubuntu следует выполнить:
sudo apt-get install ubuntu-restricted-extras
sudo apt-get install preload
Первая комманда установит все необходимое для нормальной работы — кодеки, аудио-видео, поддержку архивов, а вторая ускорит запуск программ.
* Убить пищалку или выключить наконец надоедливый Pc-Speaker:
sudo gedit /etc/modprobe.d/blacklist
добавить в конец строку "blacklist pcspkr"
* CapsLock выключается в Ubuntu:
"System > Preferences > Keyboard > Layout > Layout Options > Ctrl key position > Make CapsLock Additional Ctrl"
* Слишком частая проверка дисков. (каждые 30 запусков, иногда раздражает если включать/выключать компьютер по нескольку раз в день)
sudo tune2fs -c 0 -i 1m /dev/sda2
sudo tune2fs -c 0 -i 1m /dev/sda5
… и так для всех дисков
Это назначит проверку раз в месяц.
* Как подключить клавиатуру от Apple или любую другую USB клавиатуру в Ubuntu: здесь.
* Ubuntu: какой софт устанавливать.

Теперь про проблемы с софтом:

* Firefox прячет показывает меню при нажтии alt (сильно раздражает при смене раскладки)
"about:config -> compact.menu.altToggle"
* Firefox не хочет устанавливать аддоны: (несекьюрно)
"about:config -> NEW KEY bool extensions.checkUpdateSecurity"
* Firefox 3 жизненно необходимый плагин Tab Mix Plus находится:
http://tmp.garyr.net/dev-builds/
* Не работает Java в Firefox 3:
sudo apt-get remove icedtea-gcjwebplugin
* Utorrent под Ubuntu сильно тормозит:
"Utorrent->Options->Prefences->Connection->" Убрать птичек "NAT-PMP" и "Windows Firewall""
* Ubuntu создать архив с паролем:
Создать пустой архив, затем: "Edit->Password->Set Password" и только потом добавлять файлы.
* Ubuntu установить и настроить Photoshop CS2:
1. Установить свежую версию Wine
2.
ln -s /dev/sda ~/.wine/dosdevices/c::
sudo chmod 666 /dev/sda
3.Нормально установить и активировать Photoshop CS2
3.
sudo chmod 660 /dev/sda
* Посмотреть сколько свободной оперативки:
free -m
* После установки Virtual Box следует выполнить
sudo gpasswd -a USER vboxusers
после чего LogOut, и зайти заново.
* Установить последнюю версию Wine:
wget -q http://wine.budgetdedicated.com/apt/387EE263.gpg -O- | sudo apt-key add -
sudo wget http://wine.budgetdedicated.com/apt/sources.list.d/hardy.list -O /etc/apt/sources.list.d/winehq.list
sudo apt-get update
sudo apt-get install wine
* Ubuntu не открывается Rar, не играет видео/музыка:
sudo apt-get install ubuntu-restricted-extras
* Настройки клавиатуры не сохраняются:
sudo gedit /etc/X11/xorg.conf

и изменяем все вручную. У меня (выключенный CapsLock, переключение по Alt+Shift) выглядит вот так:
Section "InputDevice"
Identifier "Generic Keyboard"
Driver "kbd"
Option "CoreKeyboard"
Option "XkbRules" "xorg"
Option "XkbModel" "pc105″
Option "XkbLayout" "us,ru"
Option "XkbOptions" "grp:alt_shift_toggle, ctrl:nocaps"
EndSection
* При проигрывании видео слишком яркие/неправильные цвета:
В настройках видео плеера измените output c "xv" на "x11″.